המגמה המדעית גופנית מקדמת את הידע וההבנה של התלמיד על מערכות גופו כדי לדעת איזה אימון מתאיםלו, כיצד להתאים את תזונתו, כיצד למנוע פציעות ולשפר את יכולותיו הגופניות.

במגמה זו ניתן לבחור בין שני ענפי התמחות מעשיים – חדר כושר או כדורסל .

התכנים העיוניים בשני תחומי ההתמחות הם זהים :

• מבנה גוף האדם (אנטומיה)
• תפקוד הגוף (פיסיולוגיה)
• התנהגות האדם בשדה הספורט (פסיכולוגיה של הספורט) 
• ההיסטוריה של הפעילות הגופנית בארץ ( מכביות) ובעולם ( אולימפידות ).

המגמה נלמדת בכיתה (למידה עיונית) בחדר כושר ובאיצטדיון, או באולם הכדורסל (למידה מעשית) ומזכה את התלמיד ב25 אחוזי בונוס לכניסה ללימודים גבוהים (מכללות ואוניברסיטאות).

בוגרי המגמה יקבלו עדיפות צבאית לגבי אימון כושר גופני וקרבי (בה"ד 8).

המגמה מכשירה למיומנויות גופניות, חברתיות ואישיות וכמו כן משפרת כישורים אלה.

בסיום הלימודים בכיתה יב מקבלים התלמידים שעמדו בתנאים בתעודת מדריך כושר במרחב הפתוח.

מגמת כדורסל

אחת ממטרות מגמת הכדורסל היא טיפוח המצוינות ברמה האישית וברמת הנבחרות הבית-ספריות. 

מסגרת זו מגבשת ערכים של חברות, ידידות ועבודת צוות, וכן מטפחת מצוינות ומקצוענות במערכת החינוכית. 

הספורטאים הצעירים המשתתפים בתחרויות נהנים מחום ומאהדה של כל חברת התלמידים ומהווים מודל למנהיגות, הקרבה, מסורת וחברות.

המשחקים הבית ספריים ושיתופי הפעולה עם בתי ספר אחרים אינם רק משחקים ותחרויות בין נבחרות התלמידים, אלא מפעל חינוכי אדיר, שתרומתו החינוכית והערכית היא לכלל התלמידים, לצוות המורים, להנהלת בית-הספר ולקהילה כולה.

האתגר החינוכי בהכנת הספורטאים הצעירים וכן השתתפותם במשחקים עצמם מהווים רגעי שיא בחייבית-הספר ובחיי התלמידים האוהדים, שהם הקהל הנהדר ביציעים.

בצד נבחרות התלמידים נרקמות בבית-הספר תכניות לימודים ייחודיות בנושאים שונים, כמו: הגינות, מניעת אלימות, כבוד לזולת, עידוד ספורטיבי חינוכי וכיבוד דגל המדינה וההמנון. 

מטרות: טיפוח המצוינות האישית תוך שימת דגש על בנייה גופנית ספציפית, שיפור יכולות אתלטיות והעשרה טכניתוטקטית בכדורסל, בכל שכבות הגיל בנים ובנות.

התכנים במגמה: אימוני יכולת טכנית, כדורסל, סטריט בול, אימוני אתלטיקה ואימון מנטלי. 

בנוסף, התלמידים המשתתפים במגמה יוצאים לימי שיא, הרצאות ופעילויות התנדבותיות בקהילה. תלמידי המגמה גם משתתפים בתחרויות הבית ספריות המחוזיות והארציות אליהן הביקוש גדול. מגמה זו הינה מגמה ותיקה בביהס ( למעלה מ20 שנה) וההישגים להם הגיעו בוגריה הם מהגבוהים במדינה.

כדי להיכנס אליה נדרשת מוטיבציה ללמידה ולעשייה גופנית, התנהגות מכבדת וראויה מוטיבציה וסקרנות לשיפור ולשכלול יכולות.

התלמידים שיעמדו בכל התנאים יזכו בסיום הלימודים לתעודת מדריך כדורסל .